vendredi 28 février 2020

Modèles mathématiques de propagation d'épidémies


Conférence d'Etienne Pardoux, Aix-Marseille Université, 2014.
Google est bavard en ce moment sur ce thème. Voyez ce lien [1]  ou celui ci [2] (ENS) ou cherchez cet article : 'Modéliser la propagation d’une épidémie' de Hugo Falconet et Antoine Jego (Juin 2015). pdf, 31 pages.
Ces travaux utilisent généralement le modèle S.I.R (Sains, Infectés, Rétablis). Une thèse (Thi-Mai-Anh Bui, 2016), précise sa mise en œuvre [avec le langage KENDRICK de programmation]. On trouve également des implémentations de SIR en Python ou avec Matlab. Un bon vieux programme écrit en FORTRAN 77 serait tout à fait adéquat pour traiter ces trois ou quatre équations différentielles qui se battent en duel.
Si on sort de l'aspect purement mathématique de la propagation du coronavirus, on peut se poser des questions dérangeantes :
http://www.observateurcontinental.fr/?module=articles&action=view&id=1412
http://www.cnrs.fr/fr/le-sequencage-du-nouveau-coronavirus-revele-une-subtile-difference-avec-le-sras
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4797993/
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0166354220300528

Si l'ADN du coronavirus apparaît comme 'bricolé', on peut suspecter une origine militaire. Les américains ou les chinois en sont bien capables. Ensuite, le taux de mortalité est peu précis si le recensement des infectés est mal fait. La contagion peut être issue de personnes infectées ne présentant encore aucun symptôme visible. Les statistiques chinoises peuvent être biaisées ... Enfin, l'épidémie peut être suspectée d'arriver au bon moment pour détourner l'attention des peuples d'autres sujets qui fâchent ... Affaire à suivre.

NB : Deux concepts importants soulevés par E. Pardoux dans sa conférence : le modèle de Ross et le processus de Galton-Watson. Un livre de référence conseillé (en 2014) : Mathematical Tools for Understanding Infectious Disease Dynamics de Diekmann, Heesterbeek, et  Britton. 2012.

Cocorico ! La France dans le groupe de tête en matière de préparation contre les pandémies : https://www.statista.com/chart/20629/ability-to-respond-to-an-epidemic-or-pandemic/

Didier Raoult (ancien président d'Aix-Marseille 2) sur la pandémie :  Pas de panique !

...
Manifestement, il ne juge pas les modèles SIR très pertinents en la matière.


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